1.秸秆揉碎。用于微贮的秸秆一定要进行揉碎处理。养羊用3至5厘米，养牛用5至8厘米。
2.菌剂的复活和菌液配制。在处理秸秆前，先将菌剂倒入200毫升水中充分溶解，在常温下放置1至2小时，使菌种复活。复活好的菌剂一定要当天用完，不可隔夜使用。然后将复活好的菌剂倒入充分溶解的0.8%至10%食盐水中拌匀。
3.秸秆入窖。在窖底铺20至30厘米厚的秸秆，压实后再铺放20至30厘米厚的秸秆，喷洒菌液、压实、直到高于窖口40厘米，再封口。
4.加辅料。在制作过程中，要铺一层秸秆撤一层大麦粉或玉米粉、麸皮，辅料用量为总贮量的千分之五。
5.贮料的水分控制与检查。最理想的要求在60%至70%。检查方法：抓取贮料试样，用双手扭拧，有水下滴，其含水量约为80%以上，若无水滴，松开后看到手上水分很明显，约为60%至70%，若手上有水分(反光)，约为50%至55%。
6.封窖。当秸秆分层压高出窖口40厘米时，再充分压实，均匀洒上食盐粉，用量为每平方米250克，盖膜后，上加20至30米厚的稻、麦秸秆，覆土15至20厘米，封窖。
7.秸秆微贮后，窖池内贮料会慢慢下沉，应及时加盖土使之高出地面，并在周围挖好排水沟，以防雨水渗入。
8.开启和使用。封窖21至30天，即可使用。制作成功的饲料色泽呈金黄色(稻麦秸秆)或橄榄绿(青玉米)，有醇香和果香味，并具酸味。拿到手上松散，质地柔软湿润。饲喂要循序渐进。用量为每天每头(只)：奶牛、育成牛、肉牛15至20公斤，羊1至3公斤，马、驴、骡5至10公斤。
