乳酸菌发酵法(糖蜜发酵)
自然乳酸菌发酵将无污染源或无病变的原料鱼绞碎，按其重量15%的比例加入糖蜜或甘蔗制糖的下脚料，搅拌均匀后装入密闭容器内进行自然厌氧发酵。随着乳酸菌的大量繁殖，厌氧发酵产生大量乳酸，在正常情况下，3天后混合物的酸度会迅速升高，pH值降至4.5左右。由于酸的作用使原料鱼液化，蛋白质部分分解，而且抑制了腐败菌的生长，因而液体鱼蛋白饲料耐贮。发酵时间的长短，与环境温度高低有关，一般30天以后待原料鱼完全液化，pH值稳定在4.5左右即可饲用。若密闭良好，在室温下可以贮藏1年~2年。
乳酸菌的生长繁殖需要糖类物质，其添加量为10%~30%。如果没有糖蜜，可用15%~25%的玉米粉、小麦粉、木薯粉，或12.5%木薯粉加12%的木瓜粉代替。
添加乳酸菌制剂发酵在自然条件下，原料鱼、糖蜜及空气、用具、容器中的乳酸菌数量有限，且多有不良菌种，因此液体鱼蛋白质量有时不稳定。要使乳酸菌尽快繁殖，每克原料必须有10万个以上的乳酸菌，要生产优质的液体鱼蛋白饲料(特别是用淀粉原料代替糖蜜时)，需要添加乳酸菌。
乳酸菌制剂的使用方法：按原料鱼、糖蜜混合物总量的0.02%取乳酸菌制剂、糖蜜或蔗糖、葡萄糖等，各稀释100倍，配制成乳酸糖蜜混合稀释液，装入密闭的容器中，在30℃条件下培养活化24个小时，再洒入发酵混合物中搅拌均匀，进行密闭厌氧发酵。
加酸法
将鱼和鱼废弃物用锤式粉碎机磨碎，加入适量的酸，搅拌均匀，放入耐酸容器中液化、贮存，并定期进行搅拌。液化时间需七八天。加的酸可以是无机酸，如硫酸、盐酸；或有机酸，如甲酸、丙酸，也可为有机酸和无机酸的混合液。若使用硫酸、盐酸；产品pH值为2时，可获得较好贮藏效果；若使用甲酸，产品pH值为4~4.5时，贮藏效果最好。甲酸除了能加速液化外，还有杀菌作用，对容器的腐蚀性较小，而且使用方便，饲喂动物前不需中和。因此，生产液体鱼蛋白饲料都采用浓度为85%的甲酸，用量为原料鱼重量的3.5%。另外，酸的用量可根据原料的种类、鲜度和季节不同而定。若原料已开始变质或以甲壳类原料为主(如虾的废弃物)，则酸的用量需适当增加，所需甲酸量为原料重量的4%。若原料鱼中脂肪含量较高，液化后的产品最好再经脱脂处理。具体方法是：将液化得到的产品加热升温到60℃，用离心沉淀机离心去油，即可得到脱脂液体鱼蛋白饲料。将成品贮存在耐酸的有盖容器内，室温下可贮存1年~2年。
